Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpargP37238 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpargP37238 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpargP37238 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpargP37238 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpargP37238 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms