Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms