Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin1P35438 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms