Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Grin2aP35436 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2aP35436 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms