Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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