Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcdP28867 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms