Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CftrP26361 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CftrP26361 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CftrP26361 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CftrP26361 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CftrP26361 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms