Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PparaP23204 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PparaP23204 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PparaP23204 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PparaP23204 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms