Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms