Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NefhP19246 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NefhP19246 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NefhP19246 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NefhP19246 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms