Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd1P19182 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms