Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc1P19123 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms