Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa-rs1P17533 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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