Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms