Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms