Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd4P10628 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms