Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms