Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calm3P0DP28 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calm3P0DP28 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calm3P0DP28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Calm3P0DP28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms