Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnmt3cP0DOY1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms