Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb1P09055 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms