Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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