Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prp2P05143 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms