Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-Eb1P04230 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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