Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04213 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04213 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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P04213 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04213 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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