Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopeO89079 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CopeO89079 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CopeO89079 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CopeO89079 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CopeO89079 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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