Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms