Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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