Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek2O35942 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms