Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pik3cdO35904 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms