Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm2O35900 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm2O35900 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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