Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp3O35609 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp3O35609 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp3O35609 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp3O35609 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp3O35609 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp3O35609 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp3O35609 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp3O35609 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp3O35609 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms