Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptch2O35595 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptch2O35595 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms