Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms