Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-ObO35424 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-ObO35424 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms