Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc1O35379 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms