Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnih1O35372 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnih1O35372 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms