Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PbsnO08976 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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PbsnO08976 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PbsnO08976 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PbsnO08976 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PbsnO08976 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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PbsnO08976 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms