Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17078M0QW51 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms