Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc191J3QQ27 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc191J3QQ27 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms