Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8888J3QPX5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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