Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2035J3QP87 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms