Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm17577J3QNF7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm17577J3QNF7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm17577J3QNF7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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