Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc180J3QNE4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms