Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Top6blJ3QMY9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top6blJ3QMY9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Top6blJ3QMY9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top6blJ3QMY9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms