Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3336J3QMQ6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms