Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms