Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcf11G3X9Z4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms