Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms