Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms