Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms